Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms