Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms