Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav6-2Q5R1I4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms