Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl5Q5DTT4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms