Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2f8Q58FA4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms