Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms