Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhox3aQ4TU90 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox3aQ4TU90 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms