Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Fam220aQ3ZN08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam220aQ3ZN08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam220aQ3ZN08 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam220aQ3ZN08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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