Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms