Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap1-4Q3V2D6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms