Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc110Q3V125 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc110Q3V125 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms