Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc160Q3UYG1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms