Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms