Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox3Q3UT54 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms