Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms