Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms