Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rmdn3Q3UJU9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rmdn3Q3UJU9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms