Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms