Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc177Q3UHB8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms