Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zyg11bQ3UFS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zyg11bQ3UFS0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zyg11bQ3UFS0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zyg11bQ3UFS0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zyg11bQ3UFS0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms