Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms