Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LbrQ3U9G9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms