Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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Rnf149Q3U2C5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf149Q3U2C5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf149Q3U2C5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf149Q3U2C5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf149Q3U2C5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rnf149Q3U2C5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf149Q3U2C5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rnf149Q3U2C5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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