Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL09

G430049J08Rik, RIKEN cDNA G430049J08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G430049J08RikQ3TL09 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
G430049J08RikQ3TL09 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G430049J08RikQ3TL09 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms