Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam107bQ3TGF2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms