Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr27Q3SYJ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr27Q3SYJ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms