Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Treml4Q3LRV9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Treml4Q3LRV9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms