Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samd11Q1RNF8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd11Q1RNF8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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