Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd2Q149F1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms