Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne7Q0VE82 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne7Q0VE82 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms