Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncf1Q09014 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncf1Q09014 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms