Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rbp2Q08652 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbp2Q08652 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms