Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms