Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn3Q07409 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms