Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fmn1Q05860 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms