Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcn1Q05186 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms