Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms