Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox8Q04886 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms