Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms