Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms