Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx2Q03358 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms