Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms