Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfiaQ02780 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms