Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb4Q02738 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms