Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VcpQ01853 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VcpQ01853 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms