Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrcdQ00LT2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms