Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjb2Q00977 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms