Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa1Q00623 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms