Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx2Q00262 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx2Q00262 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms