Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms